気候変動に伴う降水量の変化は、河川の水量だけでなく水質にも影響を与えます。そこで、水道水源としての適性（使いやすさ）を考える上で一つの基準となる「水の濁り」が、荒川ではどのように変化するかを調査・予測しました。「生活環境の保全に関する環境基準」に照らし合わせ、水道水源としての適性別（浮遊物質濃度SSが25mg/Lを超える／超えない）に水量の変化について検討した結果、現在気候と比較して、秋ヶ瀬取水堰地点においては温暖化時には高濃度SS（懸濁物質、浮遊物質）が発生する継続日数が増えるケースが見られることが推測されます。
また、年総流出量は適用する将来気候モデルによって増えるケースと減るケースが見られましたが、水道水に適した河川水量については、5つの将来気候モデルのうち１つのケースを除き、減少傾向を示しました。これは、年総流出量が増えたとしても、必ずしも水道水源に適した水が増えるわけではないことを示しています。（流域水資源グループ）

雨水は腐りません。それは、もともと雑菌や不純物をほとんど含んでいないからです。雨はもともと、海や湖、池、沼、地表などから蒸発した水分であり、それが雲となって、雨や雪を降らせます。従って、雨の成分は蒸留水と同じ なのです。雨は、通過する大気、屋根、貯める水槽などの汚れがどの程度あるかによって、水質が変わります。それらの汚れがほとんどなければ、良好な水質を維持することができるのです。屋根雨水については、初期雨水カット（雨量の定率カット）を行うことにより、濁度は２度未満に、色度及びTOC（全有機炭素）は、水道水質基準に概ね適合できるまで維持することが可能です。
また、一般細菌数はTOCが小さく滞留時間が長いと菌数が少なくなる傾向にあります。道路排水についても、初期雨水カット（定量カット：10mm/h）を行うことにより、貯留雨水の水質が維持でき、重金属濃度も問題の無い水質レベルでした。（都市雨水管理・利用グループ）